Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Simc1E9Q6E9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Simc1E9Q6E9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Simc1E9Q6E9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Simc1E9Q6E9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 311.4 ms