Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C6E9Q6D8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C6E9Q6D8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6E9Q6D8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms