Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r56E9Q4U5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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