Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd1E9Q3H4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms