Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NebE9Q1W3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NebE9Q1W3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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