Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3893E9Q1I1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3893E9Q1I1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms