Protein–RNA interactions for Protein: E9PZG0

Apol11a, Apolipoprotein L 11a, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol11aE9PZG0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol11aE9PZG0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apol11aE9PZG0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol11aE9PZG0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms