Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcom1E9PZ54 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms