Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd1E9PZ26 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd1E9PZ26 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms