Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Abca16E9PWJ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Abca16E9PWJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abca16E9PWJ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abca16E9PWJ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abca16E9PWJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms