Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2956E9PVJ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2956E9PVJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms