Protein–RNA interactions for Protein: E9PUZ9

Pdzrn4, PDZ domain-containing RING finger 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn4E9PUZ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn4E9PUZ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn4E9PUZ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn4E9PUZ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms