Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930455H04RikD3Z622 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930455H04RikD3Z622 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms