Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm5934D3Z4U6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5934D3Z4U6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5934D3Z4U6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5934D3Z4U6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms