Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc170D3YXL0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc170D3YXL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms