Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd1D3YXK1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Samd1D3YXK1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms