Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smok3bC0HKC9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smok3bC0HKC9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smok3bC0HKC9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smok3bC0HKC9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms