Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A930018M24RikB7ZMY3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A930018M24RikB7ZMY3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms