Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700018F24RikB2RW27 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700018F24RikB2RW27 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1700018F24RikB2RW27 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms