Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn2B2RVW2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clrn2B2RVW2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clrn2B2RVW2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms