Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik3B1AS29 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik3B1AS29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms