Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint6A7XUZ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint6A7XUZ6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint6A7XUZ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint6A7XUZ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint6A7XUZ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint6A7XUZ6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint6A7XUZ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms