Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4A4UUI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4A4UUI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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