Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr16A3KMN5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr16A3KMN5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr16A3KMN5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr16A3KMN5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr16A3KMN5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr16A3KMN5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr16A3KMN5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr16A3KMN5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prr16A3KMN5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr16A3KMN5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms