Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc9bA3KGF9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms