Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt1A2BED8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms