Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fibcd1A2AV25 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fibcd1A2AV25 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms