Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl41A2AUC9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl41A2AUC9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl41A2AUC9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl41A2AUC9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl41A2AUC9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl41A2AUC9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl41A2AUC9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl41A2AUC9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms