Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn3aA2ASI5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scn3aA2ASI5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn3aA2ASI5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn3aA2ASI5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms