Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtf1A2AQ19 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtf1A2AQ19 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtf1A2AQ19 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms