Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn34dA2AGU5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34dA2AGU5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms