Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd4A2AFR3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd4A2AFR3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmpd4A2AFR3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmpd4A2AFR3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms