Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2dnl2A2AFH2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms