Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem185aA2AF53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms