Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kiaa1109A2AAE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1109A2AAE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms