Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm6268A2A3U9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm6268A2A3U9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm6268A2A3U9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm6268A2A3U9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms