Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4921501E09RikA0A0R4J054 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4921501E09RikA0A0R4J054 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms