Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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