Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sycp2lA0A0M3U1B0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms