Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms