Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Trbv21A0A0A6YX06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv21A0A0A6YX06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Trbv21A0A0A6YX06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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Trbv21A0A0A6YX06 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Trbv21A0A0A6YX06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Trbv21A0A0A6YX06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Trbv21A0A0A6YX06 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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