Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv21A0A0A6YX06 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv21A0A0A6YX06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv21A0A0A6YX06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv21A0A0A6YX06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms