Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC034090A0A087WP46 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC034090A0A087WP46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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BC034090A0A087WP46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC034090A0A087WP46 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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