Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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