Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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