Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp21Q9QZL6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp21Q9QZL6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms