Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnt3Q9QZ47 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms