Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms