Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfcp2Q9ERA0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms