Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sil1Q9EPK6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms