Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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